La automatización del almacén del servicio de farmacia ha supuesto un importante reto al hospital y por ende al servicio de farmacia.
La inversión en procesos tecnológicos tradicionalmente derivaba en los hospitales hacia los servicios centrales que atendían directamente a pacientes. Esto supone cambios e innovaciones no solamente a nivel tecnológico sino también importantes innovaciones a nivel organizativo. Supone un cambio en la forma de trabajar de todo el personal del servicio de farmacia que redunda en un trabajo mucho más optimizado y mucho más efectivo.
Ha sido un reto difícil de superar porque se trata de sistemas operativos diferentes que, de alguna manera, han tenido que hablar el mismo lenguaje y comunicarse de la misma forma para que la información fluya entre ellos, tengan un feedback siempre de entrada y de salida y que todo funcione y se corresponda con los trabajos que actualmente están haciendo tanto farmacéuticos como técnicos de farmacia.